Учреждение Российской академии наук Институт проблем морских технологий Дальневосточного отделения РАН (ИПМТ ДВО РАН), создано 01. 04. 1988 г. на основании постановления Совета Министров СССР № 1088 от 26 сентября 1987 г. и постановления Президиума Академии наук СССР № 12 от 22 января 1988 г., переименовано в соответствии с постановлением Президиума РАН от 18 декабря 2007 г. № 274.
Институт является структурным звеном РАН, и входит в состав организаций, находящихся в ведении Учреждения Российской академии наук Дальневосточного отделения РАН. Научно-методическое руководство Институтом осуществляет Отделение энергетики, машиностроения, механики и процессов управления РАН.
Организатором и первым директором Института был академик Михаил Дмитриевич Агеев, выдающийся конструктор и руководитель работ по созданию автономных необитаемых подводных аппаратов (АНПА) для исследования и освоения Океана. Научный коллектив разработчиков АНПА сформировался в 1972 г. в стенах Института автоматики и процессов управления ДВНЦ АН СССР и впоследствии стал научным ядром организованного в 1988 г. Института проблем морских технологий.